טענתה המרכזית של העירייה כנגד ההפקעה היתה כי זו מפרה הסכם הרשאה קודם שנחתם בין המדינה לעירייה במסגרתו התחייבה המדינה לא לאפשר ביצוע עבודות בשבת. בית המשפט העליון כאמור דחה את עתירת העיריה וציין כי ההפקעה נדרשה לאור פעילות העירייה עצמה שניסתה לשבש את העבודות להקמת הרכבת הקלה בעיר. "העיר בני ברק איננה שטח אוטונומי במדינת ישראל, וכאמור, היא אחת מחמש עיריות ש"הקו האדום" עובר בשטחן, כך שאת החפירה הזאת אי אפשר להפסיק" כך העליון.
בית המשפט העליון אישר הפקעת מקרקעין בבני ברק לטובת הרכבת הקלה; העליון: העיר בני ברק אינה שטח אוטונומי